Šias pareigas einantiass pareigūn vykdo šias funkcijas:

• vadovauja skyriui, formuoja tikslus ir uždavinius, planuoja, organizuoja ir kontroliuoja skyriaus veiklą, paskirsto ir vykdo pavedimus, kontroliuoja jų vykdymą; kontroliuoja ir užtikrina skyriaus darbuotojų darbo drausmę ir skyriaus veiklos dokumentų tinkamą rengimą ir tvarkymą; atsako už skyriui pavestų užduočių ir priskirtų funkcijų įgyvendinimą;
• vertina skyriaus valstybės tarnautojų tarnybinę veiklą, teikia pasiūlymus dėl skyriaus darbuotojų skatinimo;
• organizuoja informacijos, susijusios su kalėjimų, atsakingų už apsaugą, suimtųjų bei nuteistųjų priežiūrą ir įskaitą, veikla rinkimą, apibendrinimą ir pasiūlymų dėl veiklos efektyvumo gerinimo pateikimą;
• dalyvauja kalėjimų veiklos tiksliniuose patikrinimuose, atlieka budinčiųjų komandų netikėtus patikrinimus;
• teikia metodinę bei praktinę pagalbą kalėjimų darbuotojams apsaugos, suimtųjų bei nuteistųjų priežiūros ir įskaitos klausimais;
• teikia siūlymus dėl kalėjimų metinio plano priemonių;
• kontroliuoja ginkluotės įsigijimą, apskaitą, saugojimą, jos techninę būklę, išdavimą ir naudojimą kalėjimuose; 
• užtikrina ypatingų įvykių kalėjimuose užkardymą ir likvidavimą;
• pagal skyriaus kompetenciją  organizuoja kalėjimų pareigūnams pasitarimus, teorinius užsiėmimus skyriaus veiklos ir kitais aktualiais klausimais; 
• atlieka ar dalyvauja atliekant tarnybinius tyrimus, susijusius su kalėjimų apsaugos bei jose laikomų asmenų priežiūros ir įskaitos organizavimu;
• organizuoja ir dalyvauja rengiant teisės aktų projektus, susijusius su skyriaus ir kalėjimų, atsakingų už apsaugą, suimtųjų bei nuteistųjų priežiūrą ir įskaitą veikla, teikia pastabas ir pasiūlymus dėl kitų institucijų rengiamų teisės aktų projektų;
• kartu su kitomis institucijomis organizuoja pareigūnų specialiosios taktikos pratybas;
• siūlo inovacijas dėl šiuolaikinių inžinerinių ir techninių apsaugos priemonių, o joms pritarus rengia inžinerinių ir techninių apsaugos priemonių diegimo kalėjimuose studijas (koncepcijas) ir organizuoja jų įgyvendinimą; 
• teikia pasiūlymus dėl kalėjimų apsaugos, priežiūros ir įskaitos darbo organizavimo tobulinimo; 
• organizuoja Lietuvos kalėjimų tarnybos prevencinės grupės mokymus ir užtikrina nuolatinį parengties palaikymą bei Lietuvos kalėjimų tarnybos prevencinės grupės pareigūnų tobulinimąsi ir jų operatyvų išvykimą į kalėjimus, susidarius ypatingoms situacijoms;
• organizuoja ir koordinuoja tarptautinių ir tarpinstitucinių projektų, susijusių su kalėjimų apsauga, suimtųjų ir nuteistųjų priežiūra, vykdymą;
• ypatingų įvykių metu konvojuoja suimtuosius ir nuteistuosius, prireikus organizuoja kalėjimų apsaugos perėmimą;
• koordinuoja šaudymo pratybas bei kontrolinių normatyvų laikymą Lietuvos kalėjimų tarnybos pareigūnams;
• teikia siūlymus dėl Lietuvos kalėjimų tarnybos pastato leidimų režimo;
• pagal skyriaus kompetenciją dalyvauja komisijų ir darbo grupių veikloje;
• organizuoja atsakymų į valstybės ir savivaldybių institucijų ir įstaigų, visuomeninių organizacijų, kalėjimų paklausimus ir kitokio pobūdžio raštus, taip pat atsakymų į suimtųjų, nuteistųjų ir kitų asmenų prašymus, pareiškimus ir skundus rengimą ir pats juos rengia;
• vykdo kitus su skyriaus veikla susijusius nenuolatinio pavedimus.