Šias pareigas einantis pareigūnas vykdo šias funkcijas:

• organizuoja ir planuoja skyriaus darbą, atsako už skyriaus veiklos tikslų įgyvendinimą, uždavinių ir funkcijų vykdymą, veiklos organizavimą;
• organizuoja ir kontroliuoja skyriui pavestų užduočių vykdymą, pagal kompetenciją pasirašo, derina ir tvirtina skyriaus pareigūnų parengtus dokumentus;
• teikia siūlymus dėl skyriaus pareigūnų skyrimo, atleidimo, vertinimo, skatinimo ir tarnybinių nuobaudų skyrimo, pareiginės algos koeficiento nustatymo, priemokų skyrimo ir dėl kitų su skyriaus pareigūnų tarnybine veikla susijusių klausimų;
• Lietuvos kalėjimų tarnybos direktoriaus nustatyta tvarka organizuoja bausmių vykdymo sistemos pareigūnų, valstybės tarnautojų ir darbuotojų, dirbančių pagal darbo sutartis (toliau visi kartu vadinami – Darbuotojai), apsaugos nuo galimo neteisėto poveikio ir įtakos priemonių įgyvendinimą;
• organizuoja, koordinuoja ir kontroliuoja Korupcijos prevencijos įstatyme nustatytų priemonių įgyvendinimą Lietuvos kalėjimų tarnyboje, teikia pastabas ir pasiūlymus dėl korupcijos apraiškų mažinimo ir korupcijos prevencijos priemonių įgyvendinimo;
• pagal kompetenciją kontroliuoja, kaip Darbuotojai laikosi Viešųjų ir privačiųjų interesų derinimo įstatymo, veiklos ir etikos principų;
• užtikrina Lietuvos kalėjimų tarnybos pasitikėjimo linija priimtų pranešimų informacijos administravimą, apskaitą ir jų nagrinėjimą pagal kompetenciją;
• pagal kompetenciją užtikrina Lietuvos kalėjimų tarnybos organizuojamų viešųjų pirkimų antikorupcinę stebėseną;
• Lietuvos kalėjimų tarnybos pavedimu atlieka ar paveda atlikti tarnybinių nusižengimų ir darbo pareigų pažeidimų patikrinimus (tyrimus), vertina tarnybinių nusižengimų ir darbo pareigų pažeidimų tyrimo išvadų ir jų projektų pagrįstumą ir teisėtumą;
• vykdo tarnybinių nusižengimų ir darbo pareigų pažeidimų prevenciją, formuoja tarnybinių nusižengimų ir darbo pareigų pažeidimų tyrimo, nuobaudų skyrimo praktiką Lietuvos kalėjimų tarnyboje, teikia Darbuotojams metodinę ir praktinę pagalbą šioje veiklos srityje;
• Baudžiamojo proceso kodekso nustatyta tvarka organizuoja skyriaus pareigūnų, kurių viena iš funkcijų yra atlikti ikiteisminį tyrimą, taip pat kitus procesinius veiksmus, darbą ir jų veiklos kontrolę;
• Viešojo administravimo įstatymo nustatyta tvarka užtikrina skyriui pavestų nagrinėti asmenų prašymų ir skundų dėl galimų Darbuotojų neteisėtų veiksmų nagrinėjimą;
• Lietuvos kalėjimų tarnybos direktoriaus pavedimu dalyvauja įstaigų veiklos patikrinimuose, jungtinėse tyrimo grupėse ir atliekant kitas kontrolės priemones;
• pagal kompetenciją rengia teisės aktų projektus, teikia pastabas ir pasiūlymus skyriaus veiklai tobulinti;
• vykdydamas jam pavestas užduotis ir funkcijas, bendradarbiauja su Lietuvos Respublikos ir užsienio šalių teisėsaugos institucijomis, kitomis institucijomis, įmonėmis, įstaigomis ir organizacijomis;
• Lietuvos kalėjimų tarnybos direktoriaus pavedimu dalyvauja užtikrinant Darbuotojų ir visuomenės saugumą ar imantis priemonių fizinių ir juridinių asmenų, juridinio asmens statuso neturinčių organizacijų, šių organizacijų ar juridinių asmenų padalinių arba valstybės turtui gelbėti stichinių nelaimių, avarijų, katastrofų ar kitų ekstremaliųjų situacijų atvejais;
• vykdo kitus su Lietuvos kalėjimų tarnybos ir (ar) skyriaus funkcijomis susijusius nenuolatinio pobūdžio Lietuvos kalėjimų tarnybos direktoriaus pavedimus tam, kad būtų pasiekti Lietuvos kalėjimų tarnybos nustatyti tikslai ir uždaviniai.