Valstybės tarnautojas atlieka specialias teisės aktuose numatytas funkcijas:

• Įstaigos vadovui pavedus atstovauja įstaigai santykiuose su kitomis įstaigomis, organizacijomis bei fiziniais asmenimis.
• Konsultuoja su struktūrinio padalinio veikla susijusiais klausimais.
• Priima su struktūrinio padalinio veikla susijusius sprendimus.
• Rengia ir teikia pasiūlymus su struktūrinio padalinio veikla susijusiais klausimais.
• Vadovauja struktūrinio padalinio veiklos vykdymui aktualios informacijos apdorojimui arba prireikus apdoroja struktūrinio padalinio veiklai vykdyti aktualią informaciją.
• Vadovauja struktūrinio padalinio veiklų vykdymui arba prireikus vykdo struktūrinio padalinio veiklas.
• Vadovauja su struktūrinio padalinio veikla susijusios informacijos rengimui ir teikimui arba prireikus rengia ir teikia su struktūrinio padalinio veikla susijusią informaciją.
• Valdo struktūrinio padalinio žmogiškuosius išteklius teisės aktų nustatyta tvarka.
• Analizuoja Lietuvos kalėjimų tarnybos veiklą ir teikia pasiūlymus direktoriaus pavaduotojui, kuruojančiam skyriaus veiklą.
• Organizuoja ir atlieka patikrinimus Kalėjimuose pagal skyriaus kompetenciją.
• Dalyvauja komisijų ir darbo grupių veikloje, užtikrindamas komisijoms ir darbo grupėms pavestų užduočių tinkamą įgyvendinimą.
• Vertina skyriaus valstybės tarnautojų ir darbuotojų, dirbančių pagal darbo sutartis, tarnybinę veiklą, teikia siūlymus dėl skyriaus darbuotojų skatinimo.
• Užtikrina tinkamą struktūriniam padaliniui pavestų funkcijų vykdymą ir užduočių įgyvendinimą.
• Vykdo kitus nenuolatinio pobūdžio su struktūrinio padalinio veikla susijusius pavedimus.