Valstybės tarnautojas atlieka specialias teisės aktuose numatytas funkcijas:

• Bendradarbiauja su Nacionaliniu bendrųjų funkcijų pareigūnų ir karių valstybinių pensijų skyrimo, stažų skaičiavimo ir kitais personalo administravimo klausimais.
• Perskaičiuoja paskirtas Kalėjimų departamente pareigūnų ir karių valstybines pensijas, atlieka pensijų kompensuotinos dalies perskaičiavimą, užtikrindamas įstatymu nustatytos tvarkos įgyvendinimą.
• Tvarko pensijų bylas, veda jų apskaitą, teisės aktų nustatyta tvarka perduoda jas į archyvą.
• Pagal kompetenciją teisės aktų nustatyta tvarka kitoms valstybės institucijos rengia  ir teikia pažymas apie paskirtas pareigūnų ir karių valstybines pensijas, išmokas ir kitus su tuo susijusius dokumentus ar jų kopijas iš pareigūno pensijos bylos.
• Pagal kompetenciją kaupia, sistemina ir nustatyta tvarka teikia statistinius duomenis bei kitą susijusią informaciją valstybės institucijoms ir įstaigoms bei kitoms suinteresuotoms institucijoms.
• Konsultuoja priskirtos srities klausimais.
• Rengia pažymas, atsakymus į asmenų paklausimus.
• Tikslina informaciją apie deklaruojančių asmenų (vardinį) pareigybių sąrašo pasikeitimą, tikrina pateiktas Kalėjimų departamente dirbančių valstybinėje tarnyboje asmenų privačių interesų deklaracijas privačių interesų deklaravimo informacinėje sistemoje (IDIS) bei teikia konsultacijas jas pildant.
• Teisės aktų nustatyta tvarka priima, patikrina ir saugo Kalėjimų departamento kriminalinę žvalgybą vykdančių darbuotojų privačių interesų ir metinių pajamų mokesčio ir turto deklaracijas.
• Organizuoja ir koordinuoja Kalėjimų departamento pareigūnų, išleidžiamų į pensiją, integracijos į darbo rinką ir medicininės reabilitacijos priemonių sistemos įgyvendinimo tvarkos vykdymą, teikia siūlymus šiai tvarkai tobulinti.
• Kaupia, analizuoja ir apibendrina duomenis, susijusius su personalo veikla, rengia ataskaitas (pažymas) personalo veiklos klausimais, užtikrindamas bendrą ir teisingą informacijos kaupimą, rengia mėnesio ir metines ataskaitas personalo srityje.
• Renka statistinę informaciją apie pataisos pareigūnams reikalingas sveikatos priežiūros paslaugas, finansuojamas papildomai per programas iš valstybės biudžeto, ir rengia dokumentaciją pataisos pareigūnų sveikatos priežiūros paslaugų užtikrinimui (įsigijimui).
• Organizuoja pataisos pareigūnų, karjeros valstybės tarnautojų ir darbuotojų, dirbančių pagal darbo sutartis, periodinius sveikatos patikrinimus.
• Vykdo kitus nenuolatinio pobūdžio su struktūrinio padalinio veikla susijusius pavedimus.